南通市通州区人民医院
南通市通州区人民医院始建于1950年8月，是通州医疗、医学教学、医学科研和预防保健的中心，南通大学医学院、南京医科大学教学医院，国家级“爱婴医院”，上海市第一人民医院集团通州分院。2016年1月晋升为三级医院。
海安市中医院
海安县中医院于1981年选址兴建，1983年4月独立建院。建院初期仅有46名职工、20张床位。建院以来，在党的改革开放方针和新时期卫生工作方针的指引下，在县委、县政府和各级卫生主管部门的正确领导下，在社会各界的关心支持下，医院建设得到了长足的发展，1994年8月成为二级甲等中医院；1997年8月成为国家级爱婴医院；2007年11月成为南京中医药大学教学医院；2009年11月，医院与新疆伊宁市维吾尔医院缔结“友好医院”，进行对口支援。2013年1月7日成为三级乙等中医医院。
南通市第一老年病医院
南通市第一老年病医院（南通市第六人民医院、南通市肺科医院）是一所集医疗、教学、科研于一体的三级公立医院，规划床位1000张，是全国优质服务示范医院、全国人文关怀示范医院，国家节能示范单位，江苏省文明单位，南通市高质量发展先进集体。教学工作获教育部教学成果二等奖。
南通市中医院
南通市中医院始建于1956年，是首批“三级甲等中医院”和“全国示范中医院”之一、南京中医药大学南通附属医院和南通大学附属中医院。先后获得“全国红旗单位”、“全国医药卫生先进集体”、“国家中医药局创先争优先进集体”、“省、市文明单位”、“省抗非先进集体”、“江苏省五一劳动奖状”、“省院务公开先进集体”、“省、市医院管理年活动先进单位”、“南通市服务经济建设最佳单位”、“南通市先进基层党组织”、“市十佳医院”、“无红包医院”等称号。
启东市人民医院
启东市人民医院/启东肝癌防治研究所是一所集医疗、科研、教学、急救、预防保健、康复为一体的现代化三级乙等综合性医院，创建医改示范县的先行先试单位之一。是一所拥有70年历史的现代化综合医院，承载着几代创业者的希望，书写着现代医学的新篇章。
南通大学附属医院分院
南通市老年康复医院（南通大学附属医院分院），成立于1994年7月，是一所以康复医学、老年医学及慢性病治疗为特色的医教研一体的二级甲等综合医院，为自收自支的事业单位。
南通大学附属医院
南通大学附属医院由清末状元张謇先生创建于1911年，是一所省属综合性教学医院，苏中地区的医疗保健中心，1994年被卫生部首批评定为三级甲等医院，1998年被确定为国际紧急救援中心网络医院。
海门市第四人民医院
海门市第四人民医院是一所集医疗、保健、教学于一体，国家二级乙等医院，行政副科级医疗卫生机构占地面积12780平方米，职工150人，中、高级职称卫技人员62人，设有床位147张。
如皋市人民医院
如皋市人民医院地处长江三角洲北翼，创建于1921年，是一所集急救、医疗、教学、科研、预防和康复于一体的三级综合医院，是国家级爱婴医院、如皋市红十字医院，南通大学教学医院和江苏省建康职业学院教学医院，江苏省县级公立医院首批十六家综合改革试点单位，三级医院创建单位。医院先后被评为南通市先进基层党组织、南通市卫生系统先进基层党组织、南通市(如皋市)文明单位、南通市医院工作先进单位、南通市平安法治医院、南通市医改先进单位、南通市无红包医院、南通市（如皋市）卫生工作先进集体、南通市卫生系统青年文明号、如皋市科技创新
南通市第一人民医院
南通市第一人民医院暨南通大学第二附属医院、南京医科大学教学医院、南通国际友谊医院、南通市红十字医院，是一所集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院，也是卫生部国际紧急救援中心网络医院。
海安市人民医院
海安市人民医院始建于1950年，现已发展成为技术力量雄厚、设备先进、功能齐全、管理一流、花园式的三级综合性医院、爱婴医院、南通大学附属医院。医院占地面积9.8万平方米，总建筑面积9.44万平方米，实际开放床位1280张。医院年门诊46万余人次，收治住院病人近5万人次。医院先后被评为省爱国卫生先进单位、省文明医院、省十佳医院、省卫生系统先进集体、全国卫生系统先进集体。
如皋市中医院
如皋市中医院建于1975年12月；1995年被评为国家二级甲等中医院；2010年建成南京中医药大学教学医院；2012年被国家中医药管理局列入首批县级公立中医医院综合改革试点单位；2015年晋级国家三级乙等中医医院；2016年成为南京中医药大学如皋附属医院（筹）。